Publiés en un seul volume, les tomes XIII et XIV des Registres du Consistoire de Genève couvrent l’année 1558 et le début de 1559. Ces registres illustrent le fort rôle pédagogique du Consistoire et l’intensification de ses efforts pour combattre l’ignorance religieuse, qui augmente avec l’arrivée de nombreux réfugiés, connaissant mal les principes de base de la foi réformée. Le Consistoire comme le Conseil se montrent plus sévères à l’égard des gens qui retournent à Genève après avoir renié leur foi en terre catholique, même sous menace de mort. Calvin et ses collègues se préoccupent de plus en plus des biens dilapidés dans les produits de luxe et, pour la première fois, ils convoquent des personnes pour gourmandise. De la même façon, les autorités prêtent davantage attention aux activités sportives et aux jeux de hasard, qui détournent les jeunes du catéchisme.